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碧云天SNP基因分型技術(shù)服務(wù)介紹
3. 連接酶檢測反應(yīng)(LDR)分型方法
技術(shù)原理:主要應(yīng)用連接酶檢測反應(yīng) (ligase detection reaction,LDR)技術(shù)。即在Taq DNA連接酶的作用下,當左右兩條寡核苷酸探針與目的DNA序列完全互補,并且兩條探針之間沒有空隙時才能發(fā)生連接反應(yīng),否則連接反應(yīng)不能進行,最后通過熒光掃描片段長度,實現(xiàn)對SNP 位點的檢測。
4. 多重SNaPshot SNP分型方法
技術(shù)原理:SNaPshot SNP分型是一種以單堿基延伸原理為基礎(chǔ),同時利用多重PCR對多個已知SNP位點進行遺傳分型的方法。在一個含有測序酶,四種熒光標記的ddNTP,緊挨多態(tài)位點5’端的不同長度延伸引物和PCR產(chǎn)物模板的反應(yīng)體系中,引物延伸一個堿基即終止,經(jīng)ABI 3730 測序儀跑膠后,根據(jù)峰的顏色可知摻入的堿基種類,從而確定該樣本的基因型,根據(jù)峰移動的膠位置確定該延伸產(chǎn)物對應(yīng)的SNP位點。
5.Taqman 探針方法
技術(shù)原理:在PCR 反應(yīng)系統(tǒng)中加入2 種不同熒光標記的探針,它們可分別與2個等位基因完全配對。正常情況下,由于探針5′端熒光基團和3′端淬滅基團緊鄰在一起,熒光被淬滅。隨著PCR 的有效進行,與模板完全配對的探針逐步被Taq DNA 聚合酶5′→3′外切酶活性切割,致使探針5′端上的熒光基團與3′端的淬滅基團分離,淬滅效應(yīng)解除,報告熒光基團被激活;而與模板不能完全配對的探針(代表另一種等位基因)不能被有效切割,故檢測不到熒光信號,通過相應(yīng)儀器檢測熒光值的變化即可實現(xiàn)SNP位點檢測。
碧云天SNP基因分型技術(shù)服務(wù)項目表
服務(wù)編號 | 分型方法 | 技術(shù)特點 | 引物調(diào)試費 | 位點檢測費 | 服務(wù)周期 |
T0904 | 直接測序法 | 適合小樣本,位點數(shù)量大的分型檢測 | 50元/位點 | 15元/反應(yīng) | 2-4周 |
T0905 | KASP分型法 | 適合樣本量大,位點少的分型檢測 | 200元/位點 | 4.5元/位點/樣本 | 2-4周 |
T0906 | LDR(連接酶鏈式反應(yīng)法) | 100-5000個樣本,1-20個位點 | 200元/位點 | 6元/位點/樣本 | 2-4周 |
T0907 | SnapShot(小測序) | 100-5000個樣本,1-40個位點 | 300元/位點 | 5元/位點/樣本 | 2-4周 |
T0908 | Taqman探針法 | 適合幾千個樣本,位點數(shù)10個以下的分型檢測 | 2000元/位點 | 4.5元/位點/樣本 | 2-4周 |
T0909 | 客戶自定義SNP分型 | 自定義 | 詢價 | 詢價 | 協(xié)商 |
注:服務(wù)周期隨樣本量增加,需具體評估。以上表格中不含DNA提取費用,DNA提取費用見下表。
碧云天gDNA提取服務(wù)項目表
服務(wù)編號 | 分型方法 | 檢測費(元) | 服務(wù)周期 |
T0910 | 血液 | 10元/樣 | 1-2個工作日 |
T0911 | 組織 | 12元/樣 | 1-2個工作日 |
T0912 | 口腔 | 8元/樣 | 1-2個工作日 |
T0913 | 血斑(血卡) | 15元/樣 | 1-2個工作日 |
T0914 | 植物葉片 | 15元/樣 | 1-2個工作日 |
T0915 | 細菌/真菌 | 20元/樣 | 1-2個工作日 |
T0916 | 其他 | 詢價 | 協(xié)商 |
注:以上gDNA提取僅作為SNP分型的配套服務(wù),不單獨提供相應(yīng)服務(wù)。
碧云天SNP基因分型技術(shù)服務(wù)詢價與訂購
1. 請您下載并填寫碧云天SNP基因分型技術(shù)服務(wù)詢價單,發(fā)送至service@beyotime.com,我們將第一時間為您提供報價。
2. 若有訂購意向,碧云天的技術(shù)服務(wù)人員會與您聯(lián)系,并簽訂碧云天SNP基因分型技術(shù)服務(wù)協(xié)議書。
碧云天SNP基因分型技術(shù)服務(wù)優(yōu)勢
? 個性服務(wù):碧云天在SNP基因分型檢測方面積累了豐富經(jīng)驗,可根據(jù)客戶需要設(shè)計個性化檢測方案。
? 極速周期:碧云天擁有多種檢測平臺,可實現(xiàn)快速、穩(wěn)定的SNP基因分型檢測。
? 高性價比:碧云天一如既往地貫徹以最優(yōu)惠的價格為客戶提供最全面、專業(yè)的服務(wù)。
碧云天SNP基因分型技術(shù)服務(wù)客戶須知
1、SNP位點信息:
檢測人類基因組需提供SNP位點的rs號;其它物種如牛、雞、魚等無rs號的,需提供SNP位點上下游各200bp的確切序列,SNP位點的突變類型,以及告知位點的上下游25bp內(nèi)是否存在其它位點。
2、分型樣品:
(1)若分型樣品為基因組DNA,樣品要求:DNA濃度≥20ng/ul,體積>10ul,位點較多的按照1ul/位點計算。純度 OD 260/OD280 在1.7~1.9之間。如果要求提供樣品純化服務(wù),我們對每個樣品將收取相應(yīng)純化費。
(2)若分型樣品為血樣,樣本要求:血液樣品,體積大于500ul,需用抗凝劑抗凝,送樣過程中請注意保持低溫,防止DNA降解。血斑樣品,9-25mm2大小的血斑兩個以上。
(3)客戶在寄送樣品的時候,應(yīng)在送樣包裹中放置足量的冰袋,以減少在運輸過程中因溫度變化導(dǎo)致DNA降解的可能。請在每次寄出樣品后及時與本司項目負責人聯(lián)系,告知樣品的詳細信息,以便收到樣品后能第一時間處理。
碧云天SNP基因分型技術(shù)服務(wù)流程
碧云天SNP基因分型技術(shù)服務(wù)承諾
? SNPs結(jié)果(Excel表格);
? 原始SNP峰型圖;
? 完整實驗報告包括擴增和反應(yīng)的體系,所涉及的引物、探針序列等。
SNP(Single Nucleotide Polymorphisms,單核苷酸多態(tài)性)是由基因組上單個核苷酸改變而引起的DNA序列多態(tài)性,包括堿基的轉(zhuǎn)換、顛換以及單堿基的插入、缺失等,是基因突變的一種。人類基因組中SNP位點總數(shù)超過300萬個,且每個位點的多態(tài)性豐富。在人類可遺傳的變異中,SNP占比超過90%。由于SNP在人類基因組中數(shù)量較多,發(fā)生頻率較高,因此被認為是繼微衛(wèi)星之后的新一代遺傳學標記,在醫(yī)學遺傳學、藥物遺傳學、疾病遺傳學、疾病診斷學、以及人類進化等研究領(lǐng)域都有著很高的研究價值和應(yīng)用前景。
SNP研究是人類基因組計劃走向應(yīng)用的重要步驟。大量存在的SNP位點,使人們有機會發(fā)現(xiàn)與各種疾病,包括腫瘤相關(guān)的基因組突變。研究發(fā)現(xiàn),人體許多表型差異、對藥物或疾病的易感性等等都與SNP有關(guān)。
碧云天在SNP位點分析檢測方面積累了豐富的經(jīng)驗,不僅擁有先進的儀器設(shè)備,更設(shè)計開發(fā)出多種檢測手段,包括直接測序法、KASP分型法、連接酶檢測反應(yīng)(LDR)分型方法、多重SNaPshot SNP分型方法、Taqman探針法等。
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碧云天SNP基因分型方法簡介
1. 直接測序法
技術(shù)原理:將待檢測片段進行PCR擴增并直接測序,是SNP檢測方法中最準確的方法。純合位點為單峰,而雜合峰為套峰,因而很容易將幾種基因型區(qū)分開來。直接測序法不僅可用于對已知位點的檢測,還可用于發(fā)現(xiàn)未知的SNP位點。
2. KASP分型法
技術(shù)原理:KASP(Kompetitive Allele Specific PCR,競爭性等位基因特異性PCR)只需要設(shè)計并合成普通擴增引物,并利用分別帶有FAM、HEX或BHQ1修飾的通用探針引物即可實現(xiàn)對基因多態(tài)性位點的檢測。該方法不僅可以檢測SNP多態(tài)性位點,對插入缺失和特定的基因組中5甲基胞嘧啶都可以實現(xiàn)檢測。該方法不僅縮短了基因多態(tài)性檢測周期,同時也大大降低了檢測成本。
碧云天SNP檢測 技術(shù)服務(wù)介紹,SNP基因分型
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